Konoha została zniszczona, Kakashi ginie odkrywając tajemnice wroga, Tsunade poświęca się aby uratować, ludzi, najgorsze własnie nadeszło, zło, cierpienie oraz ból zawitało w Konhagakure bez ostrzeżenia.

Dzielny, młody ninja trenuje nie świadom obecnych wydarzeń, aby pomścić zamordowanego mistrza zdobywa moc aby stawić czoła morderca Jirayii. Konoha została zaatakowana Naturo musi wrócić i stanąć twarzą w twarz z wrogiem którego tak pragnął pokonać. Stojąc naprzeciw wroga Naruto oraz dwaj potężni mędrcy z góry Myōboku, musza zmierzyć się z boska siłą Rinnegana, Naruto w widowiskowy sposób pokonuje jedną z sześciu ścieżek Paina, Tsunade pozbawiona sil widzi w młodym ninja swojego zmarłego przyjaciela oraz wielkiego bohatera Konohy, teraz może spokojnie zostawić wioskę w rekach Naruto. Starcie tytanów zaskakująca nowina, uczeń kontra uczeń wspaniałego Jirayii naprzeciw sobie, walka nabiera rumieńców Naruto atakuje z pełną silą pokonując kolejne ścieżki Paina, jednakże zostaje pokonany przez ostatnie 2 ścieżki Paina. Niespodziewanie Naruto używa czakry mędrca do zamienienia rywala w żabę, absorbujący czakrę Pain pokonany, teraz tylko jeden do zakończenia zemsty. Zaskoczenie, Pain używa swojej mocy i przebija jednego z żabich mędrców, Naruto zszokowany zostaje łatwo obezwładniony, ukochana rusza na ratunek, jej klęska wznieca gniew Naruto, moc Kyuubiego zostaje uwolniona, zażarta walka, ogrom zniszczeń i jeden zwycięzca Uzumaki Naruto. Po spotkaniu ojca w swoim umyśle znajduje sile oraz odpowiedz dla Paina, Zostaje bohaterem Konoha oraz przekonuje wroga do odkupienia i wiary w przyszłość, Pain używając zakazanej techniki przywraca życie Kakashiemu i reszcie poległych ninja .